- la martre dans les 26 départements où elle était considérée ESOD. S'agissant d'une espèce inscrite à l'annexe V de la Directive habitat, les prélèvements doivent être compatibles avec son maintien dans un état de conservation favorable, au regard de données de surveillance que le Ministère de la transition écologique n'a pas été en mesure de fournir ;
- la fouine dans l’Aveyron, le Morbihan et le Territoire de Belfort ;
- le renard dans l’Aveyron, la Haute-Loire et la Lozère, en dehors des zones où il est susceptible d’occasionner des dégâts ;
- le corbeau freux dans le Nord et le Pas-de-Calais ;
- la corneille noire dans les Alpes-de-Haute-Provence, les Hautes-Alpes, l’Aveyron, les Bouches-du-Rhône, la Haute-Loire et le Vaucluse ;
- la pie bavarde dans l’Ariège, la Charente, la Haute-Garonne, le Gers, le Maine-et-Loire, la Somme et l’Essonne ;
- l’étourneau sansonnet en Corrèze, Meurthe-et-Moselle et dans la Meuse.
Le Conseil d’Etat (CE) annule également le déterrage du renard décidé par le Ministère à l'insu des préfets dans :
- les Alpes-de-Haute-Provence, les Alpes-Maritimes, l’Aude, les Bouches-du-Rhône, le Finistère, le Gard, le Jura, la Loire, le Bas-Rhin, le Territoire de Belfort et le Val-d’Oise.
A noter que la belette demeure toujours classée ESOD dans le seul département du Pas-de-Calais.
Le prochain arrêté triennal devra donc tenir compte de cet arrêt du Conseil d’Etat et des derniers travaux scientifiques (sic), notamment les rapports très critiques de la Fondation pour la recherche sur la biodiversité (FRB) et de l’Inspection générale de l'environnement et du développement durable (IGEDD) publiés respectivement en septembre 2023 et en février 2025.
Outre les ESOD, d’autres espèces sont également soumises à une régulation renforcée pour des raisons économiques, écologiques ou sanitaires, au titre d’espèces invasives, introduites volontairement ou pas sur le territoire national. On y trouve : le chien viverrin, le vison d’Amérique, le ragondin, le raton laveur et la bernache du Canada, classés en « groupe 1 » car susceptibles de perturber les écosystèmes locaux.